蛋白质糖基化位点及糖型鉴定
蛋白质糖基化位点鉴定最常用的是多级质谱法，蛋白质经Trypsin酶切消化成肽段后，再用PNGase F进行糖链的酶切，得到肽段和糖链两个部分。对于肽段，通过高分辨一级质谱可发现与肽段分子量理论值比较存在0.986Da的质量漂移，则可确定发生了糖基化，二级质谱同时可测定中性
蛋白质定性分析
bottom-up分析策略：存在于溶液或者凝胶电泳条带中的蛋白质经过蛋白酶（如胰蛋白酶）酶解消化成较小肽段片段，再进入质量分析器，最后通过肽指纹图谱或者串联质谱法进行肽段鉴定。